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食用菌栽培使用優(yōu)質(zhì)的菌種是獲得高產(chǎn)的保證，優(yōu)質(zhì)菌種的條件之一是無雜菌的純培養(yǎng)菌種。無雜菌的純培養(yǎng)菌絲體在基質(zhì)中得到充足養(yǎng)分，良好的理化環(huán)境，菌絲體可以最大限度地生長發(fā)育。如果我們使用的菌種已帶雜菌，雜菌對養(yǎng)分的吸收、對環(huán)境的適應(yīng)性都會比栽培菌絲有優(yōu)勢，而且雜菌在基質(zhì)生活，營養(yǎng)代謝過程產(chǎn)生的產(chǎn)物會改變原來基質(zhì)的理化水平，就會不利栽培菌生長，甚至無法生長。我們在制作培養(yǎng)基的過程，原料本身都會帶有雜菌的，所以菌種培養(yǎng)基配制后必須經(jīng)過滅菌，并經(jīng)嚴格抽查滅菌效果，才可進行接種，否則會造成很大的經(jīng)濟損失。

微波殺菌是微波熱效應(yīng)和非熱效應(yīng)共同作用的結(jié)果。微波的熱效應(yīng)主要起快速升溫殺菌作用：而非熱效應(yīng)則使用微生物體內(nèi)蛋白質(zhì)和生理活性物質(zhì)發(fā)生變異，而喪失活力或死亡。因此，微波殺菌溫度低于常規(guī)方法，一般比較，傳統(tǒng)的高壓蒸汽殺菌，在溫度為121℃的條件下，需要保持2h 以上才能達到滅菌效果，而微波殺菌溫度僅在70至90度，時間約為幾分鐘，乙烯塑料袋(生產(chǎn)食用菌的培養(yǎng)基包裝袋)適合于微波殺菌，并且對微波殺菌的效果沒有影響