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一、可作為培養(yǎng)料二次利用

以平菇廢料栽培草菇為例，平菇以利用纖維材料中的木質(zhì)素和半纖維素為主，很少消耗纖維素。因此，在平菇菌床廢料中，纖維素的含量相對地較高，正好滿足草菇的營養(yǎng)要求。其方法如下：栽培平菇的培養(yǎng)料在采完菇后將其菌塊打碎，曬干保藏。堆制草菇料時，在100公斤廢料中加新棉籽殼20公斤，干牛糞20-30公斤、尿素0.5公斤、石膏粉1.5-2公斤、過磷酸鈣1公斤，按常規(guī)法堆制，堆制時間可縮短2-3天，翻堆減少1次，出菇提前2-3天，與糞草堆肥的產(chǎn)量大致相同。

二、可作沼氣池的原料

用棉籽殼、稻草、鋸末作培養(yǎng)料栽培食用菌，其殘渣經(jīng)菌絲分解，更易被沼氣發(fā)酵微生物利用，可加速沼氣發(fā)酵微生物對它的分解，提早產(chǎn)氣，產(chǎn)氣率更高。

三、可作菌糠飼料

食用菌具有較強的分解能力，利用秸桿作培養(yǎng)料栽培的食用菌廢料中，粗纖維降解50％，木質(zhì)素降解30％，因廢料中含有大量的菌體蛋白，所以粗蛋白的含量由原來的2％增加到6％-7％，脂肪的含量也增加1倍左右。經(jīng)過菌絲的分解作用，秸桿材料表面的角質(zhì)層和硅細胞組織以及纖維的結(jié)晶結(jié)構(gòu)均遭受破壞，呈疏松多孔狀，降低了機械強度，易于粉碎，氣味芳香，適口性好，提高了營養(yǎng)價值。用來飼養(yǎng)豬、牛等牲畜，比米糠更好，可以達到玉米的飼用效果。菌糠飼料可以直接喂豬、牛，也可以放在青飼料打漿機中打成漿，再摻入其它飼料；也可不加工直接與其它飼料混合。

四、可作有機肥料

培養(yǎng)料殘渣所含養(yǎng)分有菌絲不能直接利用的成分，菌絲的代謝產(chǎn)物和菌絲體分解后的菌蛋白等。據(jù)分析，每噸殘渣約含氮10公斤，磷1公斤，鉀10公斤，且碳氮比值小，養(yǎng)分處于速效狀態(tài)，易被作物吸收利用。每畝施入培養(yǎng)料殘渣3000-4000公斤，可使玉米增產(chǎn)10％以上，小麥、大豆增產(chǎn)30％左右。在農(nóng)田施用培養(yǎng)料殘渣，不但可提高土壤肥力，還有助于改善土壤理化性狀，促進土壤團粒結(jié)構(gòu)的形成，增強土壤持水力和通透性。代謝產(chǎn)物中的有機酸類等物質(zhì)還能刺激根際固氮微生物的生長，有些代謝產(chǎn)物則對有害微生物的生長有抑制作用，是一種很理想的“菌肥”。